番茄在我国普遍栽培，但近年来随着日光温室设施条件的发展，经常发生番茄果实畸形的问题，据调查，早春保护地番茄畸形果的发生率一般在20%以上，高者达到单层果80%左右，严重影响了番茄的产量、品质，给生产者带来了严重的经济损失。
一、番茄畸形果种类
番茄畸形果是番茄果实生理病害（障碍）的一种，它是不整形果的统称，其类型是多种多样的，分类也各异。其中，根据番茄外果皮完整与否，将其分为两类，一类具有完整果皮，果实呈桃形、扁形、瘤形、指形等形状；另一类外果皮缺失一部分或大部分，果实呈裂果，大疤果或漏籽果。而根据果实外观形状可以分为椭圆果、链斑果、窗孔果、指突果、孪生果、顶裂果、混发果。
二、番茄畸形果发生原因
多数研究表明，同一品种番茄畸形果的发生原因可以分为两个方面：一是由于苗期花芽分化和发育不正常导致的多心室型畸形果，主要是因品种的遗传特性和营养条件的不适，造成子房心室数增多引发畸形果，如指突果、椭圆果等，二是由于果实发育过程中的不均衡导致的非多心室型畸形果，主要是坐果期使用植株生长调节剂不当造成的，如尖顶果等。
1、品种因素
番茄品种与畸形果的关系：番茄畸形果的发生与品种有一定的关系，一般认为大型果品种的畸形果较多，中小型果品种的畸形果较少。
2、苗期花芽分化和发育不良
番茄畸形果的产生主要是因为苗期花芽分化不良，导致子房心室数增多，而花芽分化正常与否，与外界环境条件、植株营养状况等因素密切相关。
（1）温度
番茄花芽分化与发育对温度有一定的要求，一般来说白天温度保持在气温25℃左右，夜间13~15℃，能够满足植株花芽分化需求。一般花芽分化前的生理分化期及形态分化初期，对6~8℃的低温为敏感，若1天时间内遭遇8小时以上6~8℃的低温，易发生畸形果。
其原因是花芽生理分化期如遇连续低温，则用于呼吸作用的养分消耗减少，从而使叶中运转到花芽中的营养物质积累，花芽营养物质变浓，使子房心皮原基的分化数目增多，心皮过度发育引起子房开裂。另一方面，低温使发育速度减缓，心皮不能均衡发育，子房形状异常，柱头偏粗，形成重瓣的复合花，进而发育成畸形果。
（2）氮素较多
番茄花芽分化和发育都需要充足的养分，在花芽分化的同时，要茎叶生长发育的需要。但幼苗在花芽分化期如果肥水过于充足，过量使用氮肥，超出花芽正产分化与发育所需要量，表现为地上部分营养生长过旺，进而根冠比例失调，终致使花器畸形，番茄心室数目增多，从而形成畸形果。另外，当水肥管理不当时，如施用过多磷肥、缺钙、缺硼等元素时，也会加剧畸形果的形成。
氮素较多和低温胁迫都是诱发畸形果的重要因子，如果两个因素叠加则会加重畸形果的发生。在北方春寒地区，春季提早番茄育苗期间，连续几天的低温寒流袭击时有发生，容易诱发产生畸形果。
3、植物生长调节剂使用不当
为达到保花保果的效果，番茄生产过程中过多使用2,4-D或防落素等植物生长调节剂，但是使用过程中药剂使用浓度过大、蘸花时间选取不当、温度不合适、重复蘸花等因素，均容易形成畸形果。
三、预防产生畸形果的措施
1、选用合适品种
根据不同生长时期和地区，选择适合品种。原则是耐低温或高温、弱光、综合抗病能力强、商品性好、坐果能力强、心室数变化较小的品种。
2、控制适宜的育苗条件
一般的番茄品种，当幼苗2~3片真叶时即开始进行花芽分化，因此在育苗期间，控制适宜的育苗条件是防止畸形果的关键。一是培育适龄壮苗，二是幼苗出土后要控制好温度和肥料使用，生产中避免8℃以下的低温炼苗和多氮肥育苗。
3、幼苗管理
控制田间温度，保持白天25℃左右、夜间13~15℃，防止长时间遭遇低温或高温；控制氮肥的使用，防止营养生长过旺，同时要注意补充硼、钙等中微量元素，施用复合甲壳素有机水溶肥料，养护根系，培育健壮植株；适当浇水，避免土壤中水分发生剧烈变化。
4、及时做好疏花疏果
正常花蕾萼片数为5-7枚，萼片在9枚以上者为畸形花，应及时摘除。每穗结合蘸花疏掉每一穗中朵早开放的花，它往往被称为“鬼花”，易形成畸形果，待每穗果坐齐后，再及时疏掉因蘸花而形成的残花和畸形果。
5、合理使用植物生长调节剂
正确合理使用生长调节剂蘸花，能够有效降低番茄畸形果的发生。
首先是选用适合的浓度。要根据植株的长势，蘸花时的温度合理配比，一般情况下，温度高时浓度低，温度低时浓度适当高；植株长势旺时，浓度适当高，植株长势弱时，浓度适当低。
其次是蘸花要选择合适的时期和时段。一般选择是一穗花第二朵和第三朵花花瓣完全开放，并且伸长到喇叭口时，点花为宜，点花过早易形成僵果，点花过晚会造成畸形果或裂果；选择在晴天上午，叶片上没有水滴时开始点花；注意点花不能重复，重复后会造成药液浓度过高，容易产生畸形果，可在配置的药液中加入少量的红色颜料或墨汁做为标记。