1.小麦播种期
因地制宜推广抗（耐）病小麦品种，压缩高感品种种植面积。对苗期不抗病的品种实施种子药剂处理，根据当地主要防控对象，选择合适的高效包衣剂或拌种药剂。针对小麦纹枯病、茎基腐病等苗期病害，选用戊唑醇、苯醚甲环唑、咯菌腈、苯醚·咯菌腈、噻呋酰胺等进行小麦种子拌种或包衣；全蚀病发生区，采用硅噻菌胺、嘧菌酯、苯醚甲环唑进行种子包衣或拌种；孢囊线虫病可采用阿维菌素种子处理。地下害虫、苗期蚜虫、小麦黄矮病发生区，选用吡虫啉、噻虫嗪、噻虫胺、毒死蜱、辛硫磷等拌种或包衣。
2.小麦出苗—越冬期
切实做好地下害虫、麦蚜、麦蜘蛛、锈病、纹枯病、茎基腐病、白粉病和孢囊线虫病等病虫的发生动态监测，在病虫害发生趋重时对早发病田及时采取防治措施，选用对路杀菌剂、杀虫剂进行防治。孢囊线虫病、根腐病发生严重的地块，在出苗后尽快采取镇压措施。
3.小麦返青—拔节期
重点开展流行性、暴发性病虫害的早期预防。黄淮麦区南部，春季注意防控条锈病早发麦田，及早控制发病中心。当田间条锈病平均病叶率达到0.5~1%时或白粉病病叶率达到10%时，及时组织开展大面积应急防治，防止病害流行危害。小麦纹枯病病株率达10%时，选用井冈霉素、噻呋酰胺、三唑类杀菌剂等喷施麦苗茎基部，每7~10天喷药一次，根据病情连喷2~3次，同时兼治小麦茎基腐病。麦蜘蛛平均33cm行长螨量200头或每株有螨6头时，可选用阿维菌素、联苯菊酯等药剂喷雾防治。对于未经种子处理的麦田，返青后地下害虫为害死苗率达10%时，可结合锄地用辛硫磷配成毒土撒施，先撒施后锄地防效更好。
4.小麦孕穗—灌浆期
根据病虫害的发生种类和程度，开展达标防治，多种病虫混合发生危害时，实施“一喷多防”。当田间发生单一病虫为害时，进行针对性防治。当田间百穗蚜量达到800头以上，天敌与麦蚜比例小于1∶150时，可用选择性杀虫剂如抗蚜威、新烟碱类药剂喷雾防治，或用苦参碱、绿僵菌等生物农药开展防治。在小麦抽穗期，吸浆虫每10复网次有10头以上成虫，或者在一行麦垄间能看到2~3头成虫时，选用高效氯氟氰菊酯、毒死蜱进行喷雾防治，并可兼治麦蚜、黏虫等害虫。麦蜘蛛平均33cm行长有螨量200头或每株有麦蜘蛛6头时，选用阿维菌素、联苯菊酯等喷雾防治。同时注意保护利用自然天敌，注意掌握化学防治指标和天敌利用指标，大力推广应用选择性农药和对天敌杀伤力较小的农药品种与剂型，如抗蚜威、噻虫嗪、啶虫脒、绿僵菌；也可根据天敌发生消长规律，适当调整施药时期，尽量避免在天敌发生的关键时期用药。注意改进施药技术，采用低容量或超低容量喷雾以及局部和隐蔽性施药法，减轻对天敌的不利影响。
小麦抽穗至扬花期是赤霉病防治关键时期，若遇阴雨、露水和大雾天气且持续3天以上，或10天内有5天以上阴雨天气时，要及时、全面开展赤霉病预防工作，选用氰烯菌酯、戊唑醇、丙硫菌唑、氟唑菌酰羟胺、丙唑·戊唑醇等杀菌剂开展防治。施药后6小时遇雨，应在雨后及时补喷。白粉病病叶率达10%或条锈病病叶率0.5~1%时，可选用三唑类等杀菌剂及时喷药防治，若病情重，持续时间长，间隔7~15天可再施用1次。
灌浆期实行“一喷三防”，选用三唑酮、烯唑醇、戊唑醇、己唑醇、丙环唑、咪鲜胺、丙唑·戊唑醇等杀菌剂，吡虫啉、啶虫脒、吡蚜酮、噻虫嗪、抗蚜威等杀虫剂，氨基寡糖素、芸苔素内酯、赤·吲乙·芸苔等植物免疫诱抗剂或生长调节剂，结合小麦长势，合理使用叶面肥等，混合喷施，一喷多防。注意农药间隔期，一般在收获前15天停止使用农药。