锰在作物体内主要有三方面的作用：
（1）、促进光合作用 今年来初步证明锰参与叶绿体的结构，约200个叶绿体分子中有34个锰原子，锰是水光解的催化剂，水光解放出的电子和氢离子参与和二氧化碳合成碳水化合物。
（2）、锰是许多酶的活化剂，如柠檬酸脱氢酶，苹果酸脱氢酶，核糖核酸聚合酶，精氨酸酶等都需要锰多催化剂，所以锰与碳素代谢、氮素代谢都有关系。
（3）、有调节氧化还原电位的作用，主要是锰本身是个变价离子，有2价，3价和4价。
锰有促进种子发芽和幼茼生长、加速花粉萌发和花粉管伸长的作用。如根据罗宗洛等人试验，用浓度为每升水中含有150毫克的锰的溶液浸种能促进种子萌发，幼苗生长。我们用0.01硫酸锰浸黄瓜种子，结果出芽整齐，跟粗且长。
作物缺锰叶片的主脉和侧脉附近为深绿色，呈现带状，叶脉间为浅绿色，这种失绿症一般出现在新的枝条上，严重缺锰的叶脉间的失绿区域变成灰绿和灰白色，叶片薄，枝条有顶枯现象。禾本科作物缺锰则出现与叶脉平行为失绿条纹（浅绿色），以后逐渐变成灰绿色、灰白色或褐红色。
作物缺锰时一般喷施0.05-0.1硫酸锰溶液。但效果不是太理想，页面喷施螯合锰是国际上植物补充锰元素的流行趋势。