为确保消费者的权益不受不法侵害，市场制定了北方种业交易市场管理办法，农资产品质量承诺制度，索证索票备查制度，农资产品准入备案制度，商品信誉卡制度，责任制度，公示制度，经营者责任制度及市场准入等一系列制度。
    种子是具有生命力，且有别于其它商品的特殊商品，在农业生产中非常重要，但种子本身以外的其它相关因素也至关重要。因此，确定种子赔偿责任的认定，其过程亦很复杂且需要一定的时间，必须由国家认可双认证的质量检验检测单位出具的鉴定结论才具有法律效力。其赔偿责任范围包括种子价款、有关费用和可得利益损失，因此种子责任的赔偿更加不同于其它一般商品的损害赔偿。
    另外，《中华人民共和国种子法》中规定生产经营农作物种子的企业必须具备100万元以上的注册资金。市场内的企业都是独立的法人企业，以其全部资产对外承担民事责任。
    因此，市场贯彻落实以上制度，对消费者的合法权益是极好的保护。一旦发生纠纷，市场将先行进行调解，以及时解决；若调解不成，则积极协助双方到种子管理部门进行解决；仍不能解决的，继续协助他们到司法机关进行解决。总之，将始终依照损害赔偿制度，双方的合法利益不受侵害。 
                                                   北京市北方种业交易市场有限责任公司